成人用药剂量
本品与其他抗逆转录病毒药物合用的推荐剂量为500或600mg/日，分2-3次给药。另外，一些研究结果表明1000mg/日，分次给药的方案是有效的。小于1000mg/日剂量齐多夫定对HIV感染引起的神经系统功能障碍是否有治疗及预防作用目前尚不清楚。
用于预防母-婴传播的剂量
下列齐多夫定的剂量已证实有效。
ACTG076研究
本品用于妊娠妇女（孕周＞14周）的推荐剂量是500mg/天口服（100mg每日五次）至开始分娩。在生产期间齐多夫定需静脉给药2mg/kg，给药时间为1小时以上。随后继续静脉注射1mg/kg/每小时至脐带结扎。
新生儿应按2mg/kg的剂量给予齐多夫定口服溶液。每6小时服药一次。生后12小时内开始给药并持续服至6周。不能口服的婴儿应静脉给予齐多夫定1.5mg/kg，每6小时给药一次，每次给药时间大于30分钟。
泰国疾病控制中心研究
用于妊娠36周妇女的齐多夫定推荐剂量为300mg，每日二次口服至开始分娩。随后口服齐多夫定300mg每三小时一次从分娩开始至生产结束。
血液系统不良反应患者的剂量调整
对于血红蛋白水平降至7.5g/dl（4.65mmol/L）-9g/dl（5.59mmol/L）或中性粒细胞计数降至0.75×10⁹-1.0×10⁹/L的患者，应减少齐多夫定的用量或中止齐多夫定的治疗。
肾功能损害者的用药剂量
与健康人相比，晚期肾衰患者齐多夫定的血浆峰浓度高出50%，系统暴露（以齐多夫定浓度—时间曲线下面积表示）增加100%，而半衰期无明显改变。肾功能的衰竭主要引起葡萄糖苷酸代谢物的贮积，该代谢物无毒性作用。晚期肾衰患者每日使用300-400mg为合适的剂量。治疗中应根据患者的血液学参数及临床反应调整剂量。血液透析及腹膜透析对齐多夫定的排泄无明显影响，而其葡萄糖苷酸代谢物的排泄增加。对于进行血液透析及腹膜透析的晚期肾病患者，推荐剂量为每6-8小时100mg。
肝功能受损者的用药剂量
从肝硬化患者中得到的资料表明，肝功能受损者由于葡糖醛酸化作用的减弱而引起齐多夫定的蓄积。肝功能受损者须进行剂量调整，但因资料有限，目前尚无理想的推荐方案。如果无法监测齐多夫定的血浆浓度，医师应特别注意患者有无不耐受的征象，并适当调整和/或延长用药间隔。