本品常见的不良反应有：口干、厌食、失眠、便秘等。
在临床试验中发生率≥1％的不良反应还有：
全身反应：发热。
(1)心血管系统：心率增快、血压升高。
(2)呼吸系统：气管炎、呼吸困难。
(3)消化系统：腹泻、胃肠炎、牙病、胃肠胀气。
(4)神经系统：不安、肢体痉挛、张力增加、思维异常、癫痫发作。
(5)泌尿生殖系统：间质性肾炎、月经紊乱。
(6)血液系统：因出血时间延长引起的皮肤淤斑。
(7)代谢和营养：外周性水肿。
(8)肌肉/骨骼系统：关节炎。
(9)肌肉和相关组织：瘙痒。
(10)特殊感觉：弱视。
实验室检查：盐酸西布曲明可引起肝功检查的异常，包括AST、ALT、GGT、LDH、碱性磷酸酶、胆红素的增加，化验值多为轻度增高，常随着进一步的治疗而消失，没有明确的剂量－反应关系。