与头孢克洛治疗有关的不良反应有：
过敏性反应：根据报道，约占病人的1.5%，包括荨麻疹样皮疹（1/100）。瘙痒、荨麻疹和库姆斯试验阳性，发生率均在1/200以下。
曾在报道，使用头孢克洛会发生血清病样反应。这种反应的特点是出现多形性红斑、皮真及其他伴有关节炎/关节痛的皮肤表现，发热或无发热。与典型的血清病不同之处在干很少与淋巴结病和蛋白尿有关，没有进入循环的免疫复合物，并且无反应后遗症的迹象。人们正在进行深入的研究，血清病样反应似乎是由于过敏，常常发生于头孢克洛第二疗程期间或正在进入第二疗程时。据报道，儿童比成年人更常发生此类反应，总发生率在依次集中试验200例中有1例（0.5%），在总的临床试验8，346例中有2例（0.024%）[在各次临床中的儿童发生率为(0.003%)]。在治疗开始后几天出现的体征和综合征，停止治疗后几天消退。这类反应偶尔会导致病人住院，但住院时间通常很短（根据上市后监测研究，平均住院时间为2-3天）。在这些需要住院的病人中，入院是其综合征轻微至严重不等，儿童中严重反应发生率较大。抗组胺剂和糖皮质激素似乎增强体征和综合征的缓解。未见有严重后遗症的报道。更为严重的过敏反应(包括Stevens-Johnson综合症、毒性上皮坏死溶解和过敏症)罕见报道，有青霉素过敏史的病人，可能更常发生过敏反应。
胃肠道综合症：发生率约2.5%，其中包括腹泻(70例中占1例)。曾有恶心、呕吐的报道。
伪膜性结肠炎综合症，可能在抗生素治疗期间或之后出现。有报道在使用大量广谱抗生素后会引起伪膜性结肠炎，暂时性肝炎，罕见于报道。胆汁郁积性黄疸曾有报道。
其他与治疗有关的副作用包括：嗜曙红细胞增多（50例中有1例）。生殖器瘙痒或阴道炎（100例中不足1例），血小板减少，间质性肾炎有报道。念珠菌病曾有报道。
因果关系尚未明确：
中枢神经系统副作用：机能亢进、神经过敏、失眠、精神错乱、高血压、头晕、幻觉和嗜睡，这些均罕见于报道。
曾有报道，临床实验室实验结果存在暂时性异常值。虽然，其病因未明，仍例举于下，为提醒医师注意的信息。
肝脏副作用：AST（SGOT），ALT9SGPT）或碱性磷酸酶值稍微升高（40例中有1例）。异常的肝功试验曾有报道。
造血系统：正如其他β内酰胺酶类抗生素报道的一样，本品可引起短暂性淋巴细胞增多、白细胞减少。罕见引起溶血性贫血、再障性贫血。粒细胞缺乏症、中性粒细胞减少、嗜酸粒细胞增多，血管性水肿曾有报道。
肾脏；BUN或血清肌酐水平稍微升高（后者人数不到1/500）或尿分析异常（人数不到1/200）。异常的肾功能试验曾有报道。
某些头孢菌素可引起癫痫病，特别是肾功能不全病人又未减少剂量时，如果发生与药物治疗有关的癫痫，应该停药。如果临床需要，可给予抗惊厥药。