以下列出的是异维A酸临床试验及上市后监测到的不良反应，部分不良事件与异维A酸治疗之间的关系尚不明确。异维A酸的大部分不良反应与维生素A过量的症状相似（主要为皮肤粘膜干燥，如唇、鼻腔和眼等）
与剂量相关的不良反应：唇炎和高甘油三酯血症常与剂量呈相关性，临床试验报道的多数不良反应为可逆性，停药后逐渐恢复，但部分在停药后仍会持续。
全身性损害：过敏反应（包括脉管炎、全身过敏反应）、水肿、疲乏、淋巴结病、体重下降。
心血管系统：心悸、心动过速、血栓形成、中风。
内分泌/代谢系统：高甘油三酯血症，血糖波动。
消化系统：炎症性肠病、肝炎、胰腺炎、牙龈出血、牙龈炎、结肠炎、食管炎/食管溃疡、回肠炎、恶心及其他非特异性胃肠道症状。
血液系统：贫血、血小板减少、中性粒细胞减少症、罕见有粒细胞缺乏症的报告。
肌肉骨骼系统：骨质增生、肌腱及韧带的钙化、骨骺闭合过早、骨密度降低、肌肉骨骼症状（部分为重度）包括背痛、肌痛、关节痛、一过性胸痛、关节炎、肌腱炎及其他骨异常，肌酸磷酸激酶升高/罕见横纹肌溶解的报道等。
神经系统：良性颅内压升高（又称假性脑瘤）、头昏、困倦、头痛、失眠、嗜睡、不适、神经过敏、感觉异常、癫痫发作、中风、晕厥、无力。
精神系统：自杀意念、自杀倾向、自杀、抑郁、精神错乱、攻击行为、暴力行为。在抑郁的相关报告中，部分患者停药后抑郁症状减轻，但再次用药后会重新出现抑郁。
生殖系统：月经紊乱。
呼吸系统：支气管痉挛（有或无哮喘史）、呼吸道感染、声音改变。
皮肤及皮肤附属器：痤疮暴发、脱发（部分患者停药后持续存在）、淤斑、唇炎、口干、鼻干、皮肤干燥、鼻衄、多形性红斑、面部潮红、皮肤脆性增加、多毛症、色素沉着及色素减退、感染（包括弥散性单纯疱疹）、甲营养不良、甲沟炎、掌跖脱皮、光敏反应、史蒂文斯-约翰逊综合征、中毒性表皮坏死松解症、瘙痒、化脓性肉芽肿、皮疹（包括面部红斑、脂溢性皮炎和湿疹）、荨麻疹、脉管炎（包括Wegener’s肉芽肿病）、伤口愈合延迟。
其他感觉：听觉：听觉损害、耳鸣。视觉：角膜混浊、停药后可能持续的夜间视力下降、白内障、色盲、结膜炎、眼干、眼睑炎、角膜炎、视神经炎、畏光、视力障碍。
泌尿系统：肾小球肾炎、非特异性泌尿系统检查发现。
实验室检查：
治疗期间出现血清甘油三酯升高、高密度脂蛋白（HDL）降低、血清胆固醇升高。
碱性磷酸酶、ALT、AST、GGTP或LDH升高。
空腹血糖升高、CPK升高、血尿酸增高。
红细胞计数降低、白细胞计数下降（包括严重中性粒细胞减少症及罕见的粒细胞缺乏症）、血沉加快、血小板计数升高、血小板减少。
尿中出现白细胞、蛋白尿，显微镜下或肉眼血尿。